Việc cải cách, đơn giản hóa thủ tục hành chính giúp doanh nghiệp giảm thời gian, chi phí khi làm thủ tục xuất nhập khẩu được lãnh đạo Cục hết sức chú trọng, xem đây là nhiệm vụ chính trị trọng tâm hàng đầu. Để hoạt động này đi vào thực chất, Hải quan Hải Phòng đã thành lập một Tổ công tác trực tiếp làm việc với rất nhiều hiệp hội doanh nghiệp cả trong và ngoài nước (trong đó có Hiệp hội gỗ và lâm sản Việt Nam) để nắm bắt được vướng mắc, khó khăn của doanh nghiệp khi làm thủ tục xuất nhập khẩu qua địa bàn Cục quản lý.